凝胶迁移或电泳迁移率实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay，EMSA)是一种用于研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用、DNA定性和定量分析的技术。生物素标记的探针依研究的结合蛋白的不同，可以是双链或者是单链DNA。

如上图所示， DNA-复合物比非结合的探针移动得慢；当检测DNA结合蛋白，可用纯化蛋白、部分纯化蛋白或核细胞抽提液；竞争实验中采用含蛋白结合序列的DNA片段和寡核苷酸片段（特异）和其它非相关的片段（非特异），来确定DNA结合蛋白的特异性；在竞争的特异和非特异片段的存在下，依据复合物的特点和强度来确定特异结合。

实验步骤