NCBI是一个非常强大的数据库软件，如何查询基因序列，如何进行引物设计，如何使用BLAST进行序列比对...这些问题在NCBI上都可以很方便的找到答案，但是对于很多新手小白来说却如同天书，不知如何使用。今天小编就跟大家一起简单的认识了解NCBI，学习如何寻找所需基因的信息。

首先，打开 NCBI 网页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ; ，选择「gene」，输入您要的基因名称（可简写），如 人胃癌Runx3基因，搜索然后，选择种属，如 homo sapiens，点击进入，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/861；

然后，使劲往下拉网页，在"NCBI Reference sequence (Refseq)"下方

NG_011402.2  就是该基因的 genomic DNA 序列号，

NM_001122607.1就是异构体 a 的 mRNA 序列号，而 NP_001116079.1就是 NM_001122607.1相应的氨基酸序列号，

同理，NM_001001890.2 →  NP_001001890.1分别是异构体 b 的 mRNA 和氨基酸序列号 NM_001754.4 → NP_001745.2分别是异构体c 的 mRNA 和氨基酸序列号。

点击进入相应页面就会出现详细的外显子、编码序列等信息。

选好 mRNA 序列号后，我们就可以利用其序列设计引物了。

以 Runx3 的异构体 c序列号 NM_001754.4 为例。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001754.4 ;点击进入。

1). source 中/map="21q22.3"是指此基因位于 21 号染色体长臂（q）2 带 2 区 3 亚区；

2). gene 1..5967 表示 Runx3 mRNA 长度 5967bp；

3). "CDS" 为 mRNA 编码氨基酸的序列：

translation="MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSYQYLGSIASPSVHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGAFTYSPTPVTSGIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMVGGERSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY" 引号所引就是 Runx3 基因编码的 Runx3 蛋白的氨基酸序列。

"191..1633"，191 是编码 mRNA 的起始位置，所以 Runx3 基因（人）编码序列长度是 1633-191+1=1443bp，编码蛋白是由 1443/3=481 个氨基酸构成。

4). exon 是外显子相应的 mRNA 序列。如 exon 249..287 number=1，是指 exon1 对应的 mRNA 位置为 249 到 287，以此类推；

5). ORIGIN 部分就是具体的碱基序列了，可以用来参照设计引物的。

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